O Programa de Pós-graduação em Cirurgia foi implantado em 1973 pelo Prof. Salomão Kelmer no nível Mestrado Por quase duas décadas, o curso evoluiu com conceitos B e A avaliados pelo conselho Federal de Educação. No início da década de 90, o Curso de Mestrado em Cirurgia passou a ser nomeado Programa de Pós-graduação em Cirurgia (PPGC-UFPE), com níveis de Mestrado e Doutorado. O Programa foi credenciado, pelo CTC da Comissão de Aperfeiçoamento de Pessoal do Ensino Superior (CAPES), com conceito 4 tendo se mantido assim nos triênios subsequentes. A primeira turma de doutores do Programa de Pós-graduação em Cirurgia foi graduada no ano de 2000. 

  Nos últimos 20 anos foram coordenadores do Programa de Pós-graduação em Cirurgia os professores: Carlos Teixeira Brandt; José Lamartine de Andrade Aguiar; Álvaro Antônio Bandeira Ferraz; Rodrigo Pessoa Cavalcanti Lira e Thiago Freire Pinto Bezerra, sendo atualmente coordenado pelo professor Esdras Marques Lins. Mais recentetemente o PPGC-UFPE tornou-se um programa multidisciplinar e multiprofissional passando a incluir no seu corpo docente e discente, profissionais das diversas áreas, como,  biomedicina, educação física, enfermagem, fisioterapia, medicina, nutrição e odontologia. 

  Desde a sua fundação o PPGC-UFPE tem formado professores e pesquisadores para atuarem nos mais diversas instituições de ensino e pesquisa do Brasil. Suas linhas de pesquisa atuais são: Aplicação clínica e experimental de biopolímeros de cana-de-açúcar, Bases fisiopatológicas do tratamento cirúrgico da obesidade mórbida e da síndrome metabólica, Carcinogênese, Investigação clínica e experimental em oftalmologia, Investigação clínica e experimental em otorrinolaringologia, Malformações congênitas e síndromes raras e Métodos diagnósticos e terapêuticos em cirurgia.